1. 應用物理及材料工程研究院，與中山大學 – 澳門大學教育部聯合重點實驗室，澳門大學
參與建設單位：中山大學及澳門大學
研究方向：開展具有特殊功能配位聚合物材料的無機 – 有機雜化材料合成、化學與晶體工程、及其在光電 – 電光轉換、能源和催化等領域的創新性研究。
2. 應用物理及材料工程研究院，與粵港澳光熱電能源材料與器件聯合實驗室，澳門大學
參與建設單位：南方科技大學、深圳市瑞豐光電子股份有限公司、深圳新宙邦科技股份有限公司、深圳市比亞迪鋰電池有限公司、澳門大學、香港大學、香港科技大學及香港理工大學
研究方向：擬在能量轉換、能量存儲及能量應用方面開展研究。
IAPME參與人員：
湯子康 講座教授，IAPME院長
潘暉 教授，IAPME副院長
3. 應用物理及材料工程研究院，與粵港澳光電磁功能材料聯合實驗室，澳門大學
參與建設單位：華南理工大學、香港大學、澳門大學、香港理工大學、香港城市大學、香港科技大學
研究方向：匯聚了我國光電磁功能材料領域重要的科學家，擬在有機發光材料、聚集誘導發光（AIE）材料、有機光伏材料、有機磁性材料方面開展研究。
IAPME參與人員：
4. 應用物理及材料工程研究院，與粵港澳中子散射科學技術聯合實驗室，澳門大學
參與建設單位：散裂中子源科學中心、香港城市大學、澳門大學、東莞理工學院
研究方向：依託大科學裝置—中國散裂中子源平臺，開展中子散射在材料科學中的應用研究，解決高性能結構材料和多功能材料等國家重大需求的技術難題。
IAPME參與人員：
湯子康 講座教授，IAPME院長
5. 應用物理及材料工程研究院，與澳門大學-深圳大學智能光電器件與系統研究中心，澳門大學
參與建設單位：深圳大學、澳門大學
合作方向：聯合培養人才, 促進雙方或任何一方的科技成果在深圳或澳門的轉化和產業化, 從而加強粵港澳大灣區科技業的競爭力。
IAPME參與人員：
湯子康 講座教授，IAPME院長